diff options
Diffstat (limited to 'Makefile.linux')
| -rw-r--r-- | Makefile.linux | 20 |
1 files changed, 3 insertions, 17 deletions
diff --git a/Makefile.linux b/Makefile.linux index 25a2e1b..0b2c0b9 100644 --- a/Makefile.linux +++ b/Makefile.linux @@ -7,7 +7,6 @@ # link to LAPACK WITH_LAPACK # 32-bit binary FORCE_32BIT # dynamic compilation FORCE_DYNAMIC -# float precision FORCE_FLOAT # Set this variable to either LNX or MAC SYS = LNX @@ -17,7 +16,6 @@ SYS = LNX WITH_LAPACK = 1 FORCE_32BIT = FORCE_DYNAMIC = -FORCE_FLOAT = DIST_NAME = gemma-0.96alpha # -------------------------------------------------------------------- @@ -45,10 +43,6 @@ LIBS = /software/gsl-2.2.1-el7-x86_64/lib/libgslcblas.a \ OUTPUT = $(BIN_DIR)/gemma -ifdef FORCE_FLOAT -OUTPUT = $(BIN_DIR)/gemmaf -endif - SOURCES = $(SRC_DIR)/main.cpp HDR = @@ -62,16 +56,8 @@ LIBS_LNX_S_LAPACK = /software/atlas-3.10.3-el7-x86_64/lib/liblapack.a \ /software/atlas-3.10.3-el7-x86_64/lib/libatlas.a -lgfortran \ -Wl,--allow-multiple-definition -# Options - -ifdef FORCE_FLOAT - CPPFLAGS += -DFORCE_FLOAT - SOURCES += $(SRC_DIR)/param_float.cpp $(SRC_DIR)/gemma_float.cpp $(SRC_DIR)/io_float.cpp $(SRC_DIR)/lm_float.cpp $(SRC_DIR)/vc_float.cpp $(SRC_DIR)/lmm_float.cpp $(SRC_DIR)/mvlmm_float.cpp $(SRC_DIR)/bslmm_float.cpp $(SRC_DIR)/prdt_float.cpp $(SRC_DIR)/mathfunc_float.cpp $(SRC_DIR)/gzstream.cpp $(SRC_DIR)/eigenlib.cpp - HDR += $(SRC_DIR)/param_float.h $(SRC_DIR)/gemma_float.h $(SRC_DIR)/io_float.h $(SRC_DIR)/lm_float.h $(SRC_DIR)/lmm_float.h $(SRC_DIR)/vc_float.h $(SRC_DIR)/mvlmm_float.h $(SRC_DIR)/bslmm_float.h $(SRC_DIR)/prdt_float.h $(SRC_DIR)/mathfunc_float.h $(SRC_DIR)/gzstream.h $(SRC_DIR)/eigenlib.h -else - SOURCES += $(SRC_DIR)/param.cpp $(SRC_DIR)/gemma.cpp $(SRC_DIR)/io.cpp $(SRC_DIR)/lm.cpp $(SRC_DIR)/lmm.cpp $(SRC_DIR)/vc.cpp $(SRC_DIR)/mvlmm.cpp $(SRC_DIR)/bslmm.cpp $(SRC_DIR)/prdt.cpp $(SRC_DIR)/mathfunc.cpp $(SRC_DIR)/gzstream.cpp $(SRC_DIR)/eigenlib.cpp $(SRC_DIR)/ldr.cpp $(SRC_DIR)/bslmmdap.cpp $(SRC_DIR)/logistic.cpp $(SRC_DIR)/varcov.cpp - HDR += $(SRC_DIR)/param.h $(SRC_DIR)/gemma.h $(SRC_DIR)/io.h $(SRC_DIR)/lm.h $(SRC_DIR)/lmm.h $(SRC_DIR)/vc.h $(SRC_DIR)/mvlmm.h $(SRC_DIR)/bslmm.h $(SRC_DIR)/prdt.h $(SRC_DIR)/mathfunc.h $(SRC_DIR)/gzstream.h $(SRC_DIR)/eigenlib.h -endif +SOURCES += $(SRC_DIR)/param.cpp $(SRC_DIR)/gemma.cpp $(SRC_DIR)/io.cpp $(SRC_DIR)/lm.cpp $(SRC_DIR)/lmm.cpp $(SRC_DIR)/vc.cpp $(SRC_DIR)/mvlmm.cpp $(SRC_DIR)/bslmm.cpp $(SRC_DIR)/prdt.cpp $(SRC_DIR)/mathfunc.cpp $(SRC_DIR)/gzstream.cpp $(SRC_DIR)/eigenlib.cpp $(SRC_DIR)/ldr.cpp $(SRC_DIR)/bslmmdap.cpp $(SRC_DIR)/logistic.cpp $(SRC_DIR)/varcov.cpp +HDR += $(SRC_DIR)/param.h $(SRC_DIR)/gemma.h $(SRC_DIR)/io.h $(SRC_DIR)/lm.h $(SRC_DIR)/lmm.h $(SRC_DIR)/vc.h $(SRC_DIR)/mvlmm.h $(SRC_DIR)/bslmm.h $(SRC_DIR)/prdt.h $(SRC_DIR)/mathfunc.h $(SRC_DIR)/gzstream.h $(SRC_DIR)/eigenlib.h ifdef WITH_LAPACK OBJS += $(SRC_DIR)/lapack.o @@ -111,7 +97,7 @@ $(OBJS) : $(HDR) clean: - rm -rf ${SRC_DIR}/*.o ${SRC_DIR}/*~ *~ ${SRC_DIR}/*_float.* $(OUTPUT) + rm -rf ${SRC_DIR}/*.o ${SRC_DIR}/*~ *~ $(OUTPUT) DIST_COMMON = COPYING.txt README.txt Makefile DIST_SUBDIRS = src doc example bin |