diff options
Diffstat (limited to 'tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py')
| -rw-r--r-- | tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py | 20 |
1 files changed, 10 insertions, 10 deletions
diff --git a/tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py b/tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py index 66850a0..a7de675 100644 --- a/tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py +++ b/tests/r_qtl/test_r_qtl2_pheno.py @@ -36,17 +36,17 @@ def test_parse_pheno_files(filepath, expected): @pytest.mark.parametrize( "filepath,expected", (("tests/r_qtl/test_files/test_phenocovar.zip", - ({"pheno": "T0", "time (hrs)": "0"}, - {"pheno": "T2", "time (hrs)": "0.0333333333333333"}, - {"pheno": "T4", "time (hrs)": "0.0666666666666667"}, - {"pheno": "T6", "time (hrs)": "0.1"}, - {"pheno": "T8", "time (hrs)": "0.133333333333333"})), + ({"id": "T0", "time (hrs)": "0"}, + {"id": "T2", "time (hrs)": "0.0333333333333333"}, + {"id": "T4", "time (hrs)": "0.0666666666666667"}, + {"id": "T6", "time (hrs)": "0.1"}, + {"id": "T8", "time (hrs)": "0.133333333333333"})), ("tests/r_qtl/test_files/test_phenocovar_transposed.zip", - ({"pheno": "T0", "time (hrs)": "0"}, - {"pheno": "T2", "time (hrs)": "0.0333333333333333"}, - {"pheno": "T4", "time (hrs)": "0.0666666666666667"}, - {"pheno": "T6", "time (hrs)": "0.1"}, - {"pheno": "T8", "time (hrs)": "0.133333333333333"})))) + ({"id": "T0", "time (hrs)": "0"}, + {"id": "T2", "time (hrs)": "0.0333333333333333"}, + {"id": "T4", "time (hrs)": "0.0666666666666667"}, + {"id": "T6", "time (hrs)": "0.1"}, + {"id": "T8", "time (hrs)": "0.133333333333333"})))) def test_parse_phenocovar_files(filepath, expected): """Test parsing of 'phenocovar' files from the R/qtl2 bundle. |