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#this is BayXSha genotype file, it should be tab-delimited
#the first three/four columns should be "Chr, Locus, cM, [Mb]" (case sensitive)
#please save as Unix format text file.
#comment line always start with a '#'
#type riset or intercross
@type:riset
#@type:intercross
@name:BayXSha
#abbreviation of maternal or paternal parents
@mat:B
@pat:S
#heterozygous , optional, default is "H"
@het:H
#Unknown , optional, default is "U"
@unk:U
#UBSHCD12
Chr Locus cM Mb BXS1 BXS2 BXS3 BXS4 BXS5 BXS6 BXS7 BXS8 BXS9 BXS10 BXS11 BXS12 BXS13 BXS14 BXS15 BXS16 BXS17 BXS18 BXS19 BXS20 BXS21 BXS22 BXS23 BXS24 BXS25 BXS26 BXS27 BXS28 BXS29 BXS30 BXS31 BXS32 BXS33 BXS34 BXS35 BXS36 BXS37 BXS38 BXS39 BXS40 BXS41 BXS42 BXS43 BXS44 BXS45 BXS46 BXS47 BXS48 BXS49 BXS50 BXS51 BXS52 BXS53 BXS54 BXS55 BXS56 BXS57 BXS58 BXS59 BXS60 BXS61 BXS62 BXS63 BXS64 BXS65 BXS66 BXS67 BXS68 BXS69 BXS70 BXS71 BXS72 BXS73 BXS74 BXS75 BXS76 BXS77 BXS78 BXS80 BXS81 BXS82 BXS83 BXS84 BXS85 BXS86 BXS87 BXS88 BXS89 BXS90 BXS91 BXS92 BXS93 BXS94 BXS95 BXS96 BXS97 BXS98 BXS99 BXS100 BXS101 BXS102 BXS103 BXS104 BXS105 BXS106 BXS107 BXS108 BXS109 BXS110 BXS111 BXS112 BXS113 BXS114 BXS115 BXS116 BXS117 BXS118 BXS119 BXS120 BXS121 BXS122 BXS123 BXS124 BXS125 BXS126 BXS127 BXS128 BXS129 BXS130 BXS131 BXS132 BXS133 BXS134 BXS135 BXS136 BXS137 BXS138 BXS139 BXS140 BXS142 BXS143 BXS144 BXS145 BXS146 BXS147 BXS148 BXS149 BXS150 BXS151 BXS152 BXS153 BXS154 BXS155 BXS156 BXS157 BXS158 BXS159 BXS160 BXS161 BXS162 BXS163 BXS164 BXS165 BXS166 BXS167 BXS168 BXS169 BXS170 BXS171 BXS172 BXS173 BXS174 BXS175 BXS176 BXS177 BXS178 BXS179 BXS180 BXS181 BXS182 BXS183 BXS184 BXS185 BXS186 BXS187 BXS188 BXS189 BXS190 BXS191 BXS192 BXS193 BXS194 BXS195 BXS196 BXS197 BXS198 BXS199 BXS200 BXS201 BXS202 BXS203 BXS204 BXS205 BXS206 BXS207 BXS209 BXS210 BXS211 BXS212 BXS213 BXS214 BXS215 BXS216 BXS218 BXS220 BXS221 BXS222 BXS224 BXS225 BXS226 BXS227 BXS228 BXS229 BXS230 BXS231 BXS232 BXS233 BXS234 BXS235 BXS236 BXS237 BXS238 BXS239 BXS240 BXS241 BXS242 BXS243 BXS244 BXS245 BXS246 BXS247 BXS248 BXS249 BXS250 BXS251 BXS252 BXS253 BXS254 BXS255 BXS256 BXS257 BXS258 BXS259 BXS260 BXS261 BXS262 BXS263 BXS264 BXS265 BXS266 BXS267 BXS268 BXS269 BXS270 BXS271 BXS272 BXS273 BXS274 BXS275 BXS276 BXS277 BXS278 BXS279 BXS280 BXS281 BXS282 BXS283 BXS284 BXS285 BXS286 BXS288 BXS289 BXS290 BXS291 BXS292 BXS293 BXS294 BXS296 BXS297 BXS298 BXS299 BXS300 BXS301 BXS302 BXS303 BXS304 BXS305 BXS306 BXS307 BXS308 BXS309 BXS310 BXS311 BXS312 BXS313 BXS314 BXS315 BXS316 BXS317 BXS318 BXS319 BXS320 BXS321 BXS322 BXS323 BXS324 BXS325 BXS326 BXS327 BXS328 BXS329 BXS330 BXS331 BXS332 BXS333 BXS334 BXS335 BXS336 BXS337 BXS338 BXS339 BXS340 BXS341 BXS342 BXS343 BXS344 BXS345 BXS346 BXS347 BXS348 BXS349 BXS350 BXS351 BXS352 BXS353 BXS354 BXS355 BXS356 BXS357 BXS358 BXS359 BXS360 BXS361 BXS362 BXS363 BXS364 BXS365 BXS366 BXS367 BXS368 BXS369 BXS370 BXS371 BXS372 BXS373 BXS374 BXS375 BXS376 BXS377 BXS378 BXS379 BXS380 BXS381 BXS382 BXS383 BXS384 BXS386 BXS387 BXS388 BXS389 BXS390 BXS391 BXS392 BXS393 BXS394 BXS395 BXS396 BXS397 BXS398 BXS399 BXS400 BXS402 BXS403 BXS404 BXS405 BXS407 BXS408 BXS409 BXS410 BXS411 BXS412 BXS413 BXS414 BXS415 BXS416 BXS417 BXS418 BXS419 BXS420 BXS421 BXS422 BXS424 BXS425 BXS426 BXS427 BXS428 BXS429 BXS430 BXS431 BXS432
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1 MSAT1.10 15.700 7.296649 B S S S S S S S S B B B S B S S S S S S B B B B S B S S S S B S B B S B B S B S S S S B S S B B S S S S B S B B S S B H B B S B S B S B B B H S B B B B B B S B B B B S S B S S B B B B S S B B S B B B S S S S S B B S H B H B S S B B B S B S S B B B S S B S S B S B B S S S B B S S S S B B S S B H S S S B B S S S S S S S S S S S S S S B S S B S S S S B B S B B S B S S B S B B B S H H B B S S S S S B S B S S S B S H B B S B S S B B S B S B S B B B B S B B S B B B S S S B B B B B B B B S B B S B S H S B B B B B B S S B B S S B S S S B S S S S B S B S S S S B S S B B S B B B B S B B S B B B S S S S S S S S S B B S S B B S S S B B S S S S S S B S B S S S B S S S S S S B B B S S S S S B S B B S S S S B B B S S S S S B B S B S B S B B S S S B S S S B S S S S B S S B S B S S S S B S S B S S S S B B S B S B S S B B S B S S B S S B B B B B
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1 T27K12 43.600 15.926702 B S S S S S S S S B S B S B B S B B B S B S S S S B S S S B B B B S S B S S B S S S B H S S B B B S S S B S S S B S S B B B H S B S B B S B S S B S B B B B S S B B S S S B B S B S S S S S B S B B B B S S B B S B B B H S S S S B B B B B B B B B B S B S B S B S S B B B B S B B S S S B B B B S S B S S S B B S S B S B S S S S B B S S S B S S S B S B S B H S S B S B S S B S S S S S B B B B S S S S B B S B S S S B S B S B S B S B B S S B S S S S S B S B B B B B B S B S S B B B B S B B B S B S S B B S S S S B S S S B B S B B S S H S B B B S B S S B B S B S B B S B B B S B S B S S B B B S B B B B S S S B S S B S B S S B B H H B B B B S S B B B B S B S S S B S B B B B B H B B B S S S S B S B S B B S S B B B S B B S B S B S B S B S S B S S S S S B S B S S B S S S S B B B B S B B B B S B S B B H S B B B S B B S B B B H S B H S S B S B B B
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2 MSAT2.5 0.000 0.208178 B S S S B B B B B H B B B B S S B B B B S B S S B B S S B S B S B S S B B S B B B B S S B B S S S S S S S S H B S B S S S B S S B S S S B B B S B S B B S B H B B S B B S B B B B B B S S S H S B S B S S B B S B B B S B B S H B B B S B B S S S B S S S S B B S B S B B B S S S B B S B S B S S B S S S S B S B B S B B B B B B B S B B S B S S S B B B B H B S S S S S B S B B B S S S S S B S B S S S H S B B S S B B S S H S S S B B S S B H B B B S S B S B B H B S B B B S B S B B B B S S S B S S B H S B S S S S S B B B B S B B S B S S S S B S B B S B B S S S B S B B B B S B S S S B S B S B B S B S S S B B B B B S B B S S S S S B S S S S B B S S B S B S B B B H B S S B S S S S B B B B S B S B H S B B S S S B B B S B B S S S B S B S B B S B S S S S B S S B H B B B S S S S B B B B S B B S B B S B S S S B S S B S B S S S S S B S S H S B B H S
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4 MSAT4.9 55.900 15.790523 B B S S S S S S B S B B S B S B S S S S S B S S S B B B H B B H S S B S S B S S B S B S B B B H S S H S S B B S H S S H S B B B B B B S S S B B S B B B H B B S B S S B S S S B S S B H S B S S S S S B S S S S S B B S B B S S S B S B S S B B B S S B S S B S B S S B H S S S B S B S S B B B B S B S B B S B H B B S S S B S S S B S S S S B S S S B B S H S S S S H S S S S S S S S H B S B S H B S B B B S S S B S S S S S S S S S B B S S B H S S S B S B S B S S S B S B S B S B S B S S S B S S B S S S S S H S S B H B S B S S S S S B S B S S S B S S B B S S H B S S S B B B S S S S S S S S S B S B S S S B B H B B S S S S B S B B S B B B S S S S B B B B S S B B S S S S S S S B S S S S H S B S S S S S S B B B S S S S S B S B H B S S B B S B S B S S S S S S S S S S B S S S S S S B B B S S B S B S S B B S B S S B S S S B S S B B S S S B B B S S
4 MSAT4.37 69.900 18.336495 B B S S S S B S B S B B S B S B S S S S H B S S S B B B H B B H S S B B S H H H S B S B S B B S B S S S B B B B S S S S B S B B B B S S S S S B S B B B H B B B B B B B S S S B B S S S B S S B S S S B S S S S S S B B B B S S B B B B S S B B B S S B S S B S B S S B S B S B B S B B B S B B B S B S B B S B S S B S H S S S S S B S S B S B S S S B B S H S S B S H S S S B S S S B H B B B S S H S B B B B S S B S S S B S S S S B B B B S B H S S H B S B S B B B S S S B H B S B S B B B S B H S B S S S S S H S H B S B S S S S S B S B S S B S S B S S B B B S H S S S S B B B S S B S S S S B S S S B S B S S B S B B S S S S B S B S S H B S B S B S S B S B S S S B S S B S S S H B S S S S S S B S S B H B S B B B S S S S S B S H S B S S B B S B S B B S S S S S B S S S B S S S S B S B S B B S S B B S S B B S B B S B S S S B S B B B B B B B B S S S
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