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#!/usr/bin/python2
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# Last Updated Apr 11, 2016 By Arthur and Zach
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import string
import sys
import MySQLdb
import getpass
import time
import csv
########################################################################
with MySQLdb.connect(
host='localhost', user='username', passwd='', db='db_webqtl') as mydb:
with mydb.cursor() as cursor:
csv_data = csv.reader(file('GN711_pvalues.txt'), delimiter ="\t")
for row in csv_data:
cursor.execute(
"""UPDATE ProbeSetXRef SET pValue = %s WHERE ProbeSetFreezeId = %s AND ProbeSetId = %s """,
(row))
print("Done")
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