From d391c4ca17a32c672b6aa65bb586d73eee4b48fc Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Zachary Sloan
Date: Thu, 21 Feb 2013 16:26:22 -0600
Subject: Adding genotypes and new_genotypes (json files) directories to git so
 they can be pulled to the new EC2 server

---
 web/genotypes/AXBXAMB | 669 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 1 file changed, 669 insertions(+)
 create mode 100755 web/genotypes/AXBXAMB

(limited to 'web/genotypes/AXBXAMB')

diff --git a/web/genotypes/AXBXAMB b/web/genotypes/AXBXAMB
new file mode 100755
index 00000000..94640d4c
--- /dev/null
+++ b/web/genotypes/AXBXAMB
@@ -0,0 +1,669 @@
+Chr	Locus	Mb	CM
+1	D1Mit296	9.79896	8.3
+1	D1Mit67	13.378082	9
+1	D1Mit430	14.419923	10
+1	D1Mit3	20.02331	11
+1	D1Mit231	21.073617	12
+1	D12Mit63	23.055011	13.5
+1	D1Mit169	24.453308	14
+1	D1Mit211	25.909845	15
+1	D1Mit373	26.87751	17
+1	D1Mit318	34.24077	17.5
+1	D1Mit170	36.524747	19.5
+1	D1Mit171	37.245777	19.6
+1	D1Mit123	39.601354	21
+1	D1Mit213	43.852441	25.7
+1	D1Mit161	59.839005	27
+1	D1Mit480	64.503647	32.8
+1	D1Mit76	66.493067	33.5
+1	D1Mit178	69.368406	34
+1	D1Mit128	73.210542	36.9
+1	D1Mit77	74.413559	36.9
+1	D1Mit132	77.998633	43.1
+1	D1Mit215	79.055962	49
+1	D1Mit334	82.080621	49.7
+1	D1Mit81	86.159619	51
+1	D1Mit80	86.777907	53.2
+1	D1Mit45	93.463703	58.5
+1	D1Mit386	100.943173	59.5
+1	D1Mit137	107.717123	62
+1	D1Mit26	112.725099	62.1
+1	D1Mit309	119.039556	63
+1	D1Mit13	123.528972	63.1
+1	D1Mit94	126.967975	64.5
+1	D1Mit218	128.231931	67
+1	D1Mit140	135.158527	70
+1	D1Mit199	140.838092	71
+1	D1Mit100	144.767833	71.5
+1	D1Mit194	147.906816	72
+1	D1Mit425	157.740846	79
+1	D1Mit105	161.634644	82
+1	D1Mit452	164.339568	86.6
+1	D1Mit15	169.567767	91
+1	D1Mit455	171.698618	92
+1	D1Mit113	173.088033	92.3
+1	D1Mit456	173.849042	95.8
+1	D1Mit356	174.188158	98
+1	D1Mit315	180.290708	101
+1	D1Mit291	185.828822	101.2
+1	D1Mit361	187.381927	101.5
+1	D1Mit17	189	106.3
+1	D1Mit462	192.701629	108
+1	D1Mit511	193.701629	109.6
+1	D1Mit155	195.960746	112
+2	D2Mit1	3.828391	1
+2	D2Mit355	4.571151	2.2
+2	D2Mit117	8.772013	4.5
+2	D2Mit359	9.379193	5
+2	D2Mit5	9.401771	6.5
+2	D2Mit314	9.646328	6.6
+2	D2Mit79	22.201711	9
+2	D2Mit82	26.144295	16
+2	D2Mit365	28.122897	20
+2	D2Mit295	29.756517	21
+2	D2Mit367	34.045483	27
+2	D2Mit7	38.673421	29.5
+2	D2Mit269	46.847434	30
+2	D2Mit90	66.41909	37
+2	D2Mit380	70.393871	37.9
+2	D2Mit56	71.536045	38
+2	D2Mit94	81.0553	46
+2	D2Mit14	86.652442	48.5
+2	D2Mit184	100.391314	53
+2	D2Mit43	105.008872	53.2
+2	D2Mit58	109.197095	53.4
+2	D2Mit480	110.903694	53.5
+2	D2Mit207	113.131399	54.3
+2	D2Mit102	115.22489	54.5
+2	D2Mit420	119.315979	54.8
+2	D2Mit397	123.816844	56.8
+2	D2Mit255	124.383359	69.1
+2	D2Mit525	132.684572	71.4
+2	D2Mit401	143.251228	71.5
+2	D2Mit340	149.892442	71.6
+2	D2Mit493	154.789584	73
+2	D2Mit286	155.337103	74
+2	D2Mit409	159.383119	74.3
+2	D2Mit411	160.467744	77.6
+2	D2Mit412	163.258265	78.7
+2	D2Mit51	163.920733	81
+2	D2Mit414	169.537412	85.2
+2	D2Mit229	169.783577	85.5
+2	D2Mit343	170.278805	86
+2	D2Mit344	171.948164	88.2
+2	D2Mit147	173.609596	91
+2	D2Mit528	174.212354	92
+2	D2Mit113	174.587325	103
+2	D2Mit148	177.113416	105
+2	D2Mit266	180.203936	109
+3	D3Mit164	7.593984	2.4
+3	D3Mit256	10	3
+3	D3Mit62	17.282725	4.6
+3	D3Mit203	26.763422	11.2
+3	D3Mit46	29.826319	13.8
+3	D3Mit167	32.122852	16.5
+3	D3Mit21	36.739436	19.2
+3	D3Mit94	40.09938	21
+3	D3Mit63	41.0247	21.5
+3	D3Mit6	49.112197	23.3
+3	D3Mit5	51.234535	24
+3	D3Mit173	59.13602	26
+3	D3Mit7	60.79464	26.4
+3	D3Mit228	64.387248	30
+3	D3Mit154	69.409337	33
+3	D3Mit52	71.97128	34.4
+3	D3Mit244	80.405334	36
+3	D3Mit9	83.729921	38.3
+3	D3Mit155	87.912261	40.5
+3	D3Mit74	88.97473	41
+3	D3Mit141	93.947865	45.2
+3	D3Mit11	100.657405	49
+3	D3Mit266	103.997286	51.1
+3	D3Mit286	109.527558	52.5
+3	D3Mit106	112.537577	55
+3	D3Mit216	123.829768	58.8
+3	D3Mit348	127.522719	60
+3	D3Mit109	131.216184	61.8
+3	D3Mit110	132.392294	66
+3	D3Mit14	132.512408	66.1
+3	D3Mit291	136.857404	66.2
+3	D3Mit127	143.59837	70.3
+3	D3Mit17	144.162011	71.8
+3	D3Mit292	146.845044	72.9
+3	D3Mit86	147.874726	76.2
+3	D3Mit147	149.278227	79.4
+3	D3Mit128	151.312623	83.5
+3	D3Mit116	155.13022	84.9
+3	D3Mit89	157.445891	86.1
+3	D3Mit19	158.328338	87.6
+4	D4Mit101	9.177855	3.2
+4	D4Mit18	13.513463	5.2
+4	D4Mit171	24.043341	6
+4	D4Mit2	25.266164	6.5
+4	D4Mit292	33.039105	6.6
+4	D4Mit172	34.051915	10
+4	D4Mit237	41.909821	13.3
+4	D4Mit286	42.032485	14.5
+4	D4Mit214	44.499033	17.9
+4	D4Mit6	48.828236	20.8
+4	D4Mit110	51.737281	21.5
+4	D4Mit111	52.424945	21.9
+4	D4Mit288	55.667744	28.6
+4	D4Mit164	58.321773	29.6
+4	D4Mit178	64.500735	35.5
+4	D4Mit80	76.892535	37.7
+4	D4Mit152	80.650766	40
+4	D4Mit186	88.751003	44
+4	D4Mit145	92.141134	44.5
+4	D4Mit175	98.164489	49
+4	D4Mit155	100.282259	49.6
+4	D4Mit331	101.614294	50.8
+4	D4Mit31	104.835428	51.3
+4	D4Mit332	112.274496	53.6
+4	D4Mit37	114.976112	56.5
+4	D4Mit334	117.622076	56.7
+4	D4Mit12	121.685242	57.5
+4	D4Mit147	122.221009	57.6
+4	D4Mit249	123.089309	58.2
+4	D4Mit336	124.753995	59
+4	D4Mit16	125.510037	59.1
+4	D4Mit203	127.075335	60
+4	D4Mit204	130.996592	61.9
+4	D4Mit251	134.516767	65
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+4	D4Mit343	140.459433	70
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+4	D4Mit127	145.31813	77.5
+4	D4Mit14	145.524095	78.5
+4	D4Mit226	145.928615	78.5
+4	D4Mit344	150.967544	81.7
+5	D5Mit346	9.005911	0.5
+5	D5Mit193	9.653755	1
+5	D5Mit331	9.7	3
+5	D5Mit61	20.303233	7
+5	D5Mit349	23.443625	8
+5	D5Mit388	32.01546	18
+5	D5Mit352	34.323756	20
+5	D5Mit13	36.31786	20.1
+5	D5Mit267	43.677142	23
+5	D5Mit11	46.855017	26.5
+5	D5Mit81	49.325213	27
+5	D5Mit55	51.606683	28
+5	D5Mit233	51.766077	29.1
+5	D5Mit255	54.023547	30
+5	D5Mit197	63.716526	36
+5	D5Mit15	64.49851	39
+5	D5Mit356	73.171344	41
+5	D5Mit201	74.472475	42
+5	D5Mit312	93.902304	50
+5	D5Mit20	95.39079	51.5
+5	D5Mit155	97.222809	52
+5	D5Mit10	101.834871	55
+5	D5Mit403	103	57
+5	D5Mit240	106.801485	58
+5	D5Mit25	111	59.8
+5	D5Mit24	111.358492	60
+5	D5Mit188	116.898691	64
+5	D5Mit367	117.907708	65
+5	D5Mit279	122.701216	68
+5	D5Mit95	123.06716	68.5
+5	D5Mit139	123.698739	69
+5	D5Mit370	125.043462	70
+5	D5Mit371	126.341772	72
+5	D5Mit165	131.455567	74
+5	D5Mit32	134.526559	80
+5	D5Mit99	144.046611	83
+5	D5Mit409	144.799669	89
+6	D6Mit86	4.168665	0.5
+6	D6Mit264	16.529689	3.2
+6	D6Mit116	25.111997	6
+6	D6Mit307	29.097875	7
+6	D6Mit341	29.1	7
+6	D6Mit273	47.196957	19
+6	D6Mit74	47.977836	20.5
+6	D6Mit33	51.270997	25.5
+6	D6Mit93	52.452256	26.3
+6	D6Mit183	53.689522	26.5
+6	D6Mit384	55.602474	28
+6	D6Mit316	55.961001	28.9
+6	D6Mit175	65.534554	29.9
+6	D6Mit188	76.337439	32.5
+6	D6Mit19	83.288604	33.5
+6	D6Mit210	83.5	34
+6	D6Mit29	87.664428	36.5
+6	D6Mit102	94.243399	40.5
+6	D6Mit67	98.569722	41.5
+6	D6Mit65	102.215058	45
+6	D6Mit39	107.40806	45.5
+6	D6Mit327	110.17221	46.5
+6	D6Mit104	111.806058	47
+6	D6Mit108	112.171465	48.2
+6	D6Mit54	113.171788	48.5
+6	D6Mit252	115.415685	49.5
+6	D6Mit52	128.751322	50
+6	D6Mit368	128.8	50.3
+6	D6Mit61	129.440906	53
+6	D6Mit254	131.079711	53.5
+6	D6Mit194	132	61.5
+6	D6Mit13	132.918101	63.4
+6	D6Mit25	136.5	63.5
+6	D6Mit339	136.779293	65
+6	D6Mit374	139.295979	65.1
+6	D6Mit59	139.382121	67
+6	D6Mit57	145.839764	71
+6	D6Mit14	145.9	72
+6	D6Mit26	147.987053	73
+6	D6Mit304	148.16523	75
+7	D7Mit178	3	0
+7	D7Mit263	13	2.2
+7	D7Mit191	13.928205	2.5
+7	D7Mit115	18.582076	7
+7	D7Mit77	19.8409	7.9
+7	D7Mit294	19.9	8
+7	D7Mit114	20	8.1
+7	D7Mit246	22.610551	12.1
+7	D7Mit268	26.037289	16
+7	D7Mit224	26.189952	16.05
+7	D7Mit309	26.934643	16.1
+7	D7Mit227	27.093217	16.3
+7	D7Mit25	27.386334	16.4
+7	D7Mit310	30.922205	17.9
+7	D7Mit229	35.261041	23
+7	D7Mit145	41.025444	26.5
+7	D7Mit70	45.475943	27.8
+7	D7Mit195	54.990571	28.5
+7	D7Mit297	55.144097	29
+7	D7Mit233	57.905491	34.5
+7	D7Mit318	63.402564	36.5
+7	D7Mit213	69.032953	38.1
+7	D7Mit30	70.994227	39.3
+7	D7Mit319	71.55131	40.8
+7	D7Mit31	77.218152	44
+7	D7Mit301	81.329158	46.5
+7	D7Mit321	87.647898	48.5
+7	D7Mit126	91.019082	49
+7	D12Mit38	92	49.5
+7	D7Mit281	101.82668	52.4
+7	D7Mit222	102.548419	52.6
+7	D7Mit238	108.74216	53
+7	D7Mit66	109.535334	57.5
+7	D7Mit285	112.142297	59
+7	D7Mit68	115.18703	60
+7	D7Mit105	118.435194	60.5
+7	D7Mit186	120.604147	64
+7	D7Mit71	120.999229	65.1
+7	D7Mit371	122.235366	65.2
+7	D7Mit332	124.030999	65.6
+7	D7Mit259	135.201914	72.4
+8	D4Mit158UT	13.5	5
+8	D8Mit124	14.727194	6
+8	D8Mit335	19.746602	7
+8	D8Mit95	23.253314	8
+8	D8Mit289	27.58257	11
+8	D8Mit94	30.247805	13
+8	D8Mit63	31.737313	15
+8	D8Mit64	31.75	16
+8	D8Mit224	31.987599	17
+8	D8Mit189	33.19668	18
+8	D8Mit125	33.776582	20
+8	D8Mit69	55.726255	31
+8	D8Mit128	60.461407	31
+8	D8Mit25	63.817033	32
+8	D8Mit8	63.9171	32
+8	D8Mit131	65.332245	33.2
+8	D8Mit31	70.672163	34
+8	D8Mit305	81.992306	37
+8	D8Mit348	86.815265	39
+8	D8Mit45	87.023104	40
+8	D8Mit266	89.949905	44.5
+8	D8Mit312	95.317119	45
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+17	D17Mit2	79.858098	49.7
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+18	D18Mit9	68.88773	42
+18	D18Mit185	69.368647	43
+18	D18Mit8	74.802001	48
+18	D18Mit4	84.715351	57.1
+19	D19Mit109	4.61806	1.5
+19	D19Mit68	7.187012	2
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+19	D19Mit42	9.421041	5
+19	D19Mit127	12.12845	9
+19	D19Mit61	15.126886	10
+19	D19Mit128	16.880657	10.9
+19	D19Mit85	18.173766	12
+19	D19Mit41	18.321636	12.5
+19	D19Mit23	20.085699	13.1
+19	D19Mit14	20.978533	15.2
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+19	D19Mit86	26.055691	18.5
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